перевод, произношение, транскрипция, примеры использования
Местный музей стоит того, чтобы его посетить.
Магазин торгует ремесленными изделиями местного производства.
The local paper did a piece about me.
Местная газета опубликовала обо мне статью.
She had to adapt herself to local conditions.
Ей пришлось приспосабливаться к местным условиям.
The local war escalated into a major conflict.
Эта локальная война переросла в серьёзный конфликт.
She works for a local radio station.
Она работает на местной радиостанции.
That’s what the locals call the lake.
Местные так называют это озеро.
The local team was favored.
Местная команда считалась фаворитом соревнований.
So where to source: local or global?
Где же искать поставщиков: локально или глобально?
Prizes were given by local merchants.
Призы были вручены местными торговцами.
Many people knew him as a local businessman.
Его многие знали как местного бизнесмена.
The local hospital has been saved from the axe.
Местную больницу спасли от закрытия.
She belongs to a local health club.
Она является членом местного оздоровительного клуба.
I think the local police are in with the criminals.
Думаю, что местная полиция находится в сговоре с преступниками.
It’s on at the local cinema.
Этот фильм идёт в местном кинотеатре.
A local TV station ran her story.
Её сюжет показывали на одном из местных телеканалов.
Local government was inefficient.
Местная власть оказалась неэффкетивной.
She teaches art at a local college.
Она преподает изобразительное искусство в местном колледже.
He buses tables at the local diner.
Он убирает со столов (за посетителями) в местном речторанчике.
Contact your local dealer to order.
Для размещения заказа обратитесь к вашему местному дилеру.
She was treated by her local doctor.
Её лечил местный доктор.
We adopted some of the local customs.
Мы приняли некоторые местные обычаи.
The local Mafia won’t touch gambling.
Местная мафия не тронет игорный бизнес.
Our local hardware shop has shut down.
Наш местный хозяйственный магазин закрылся.
They sell rugs made by local artisans.
Они продают ковры, сделанные местными мастерами.
local перевод и транскрипция, произношение, фразы и предложения
[ˈləʊkəl]
Добавить в закладки Удалить из закладок
прилагательное
- местный (локальный, отечественный, здешний, поместный)
- частный
Синонимы: partitive, partial, peripheral, privately.
Фразы
local authority
местная власть
local machine
локальный компьютер
local industries
отечественная промышленность
local house
здешний дом
local order
поместный приказ
Предложения
My wife works as a nurse at a local hospital.
Моя жена работает медсестрой в местной больнице.
We have to respect local customs.
He married a local girl.
Он женился на местной девушке.
Mary works as a waitress at a local cafe.
Мэри работает официанткой в местном кафе.
Do not fear the heavens and the earth, but be afraid of hearing a person from Wenzhou speak in their local tongue.
Не бойся неба и земли, бойся услышать человека из Вэньчжоу, говорящего на местном диалекте.
I like to go to a local jazz club where I can enjoy live music.
Мне нравится ходить в местный джаз-клуб, где я могу насладиться живой музыкой.
Tom works at a local hospital.
Том работает в местной больнице.
She works as a nurse in the local hospital.
Она работает медсестрой в местной больнице.
Our children all go to the local school.
Все наши дети ходят в местную школу.
We have made several failed attempts at foresting the local landfill.
Нами предпринят ряд попыток по засаживанию лесом местной свалки.
Of course there should be local hospitals.
Конечно, там должны быть местные больницы.
This is one of the best local newspapers.
Это одна из лучших местных газет.
Harry works part-time at the local supermarket.
Гарри работает неполный рабочий день в местном супермаркете.
They used local wood to build the ships.
Они использовали местную древесину для строительства кораблей.
Markku joined the local football club.
Маркку вступил в местный футбольный клуб.
The team was outfitted by one of the local stores.
Команда была экипирована одним из местных магазинов.
Local politicians opposed the enlargement of the European Union.
Местные политики выступили против расширения Евросоюза.
I’ll give you a local anaesthetic.
Я сделаю вам местную анестезию.
Are local trains included on this schedule?
В этом расписании указаны поезда местного сообщения?
In particular, the endomorphism ring of M is a commutative local ring.
В частности, кольцо эндоморфизмов модуля M является коммутативным локальным кольцом.
Tom spent the better part of the day writing an article for a local magazine.
Том потратил лучшую часть дня на написание статьи для местного журнала.
What’s the local time in Tokyo now?
Какое сейчас местное время в Токио?
At that very night when the fern blooms — I’m just retelling what has been composed in the fairy tales by local people — the mermaids, wood and house goblins, werewolves, nix, and different kinds of ghosts and sorcerer gathered together.
В ту самую ночь, когда зацветает папоротник, — я просто пересказываю то, что уже сложено в сказках здешними людьми, — собрались на сходку русалки, леший, вурдалаки, водяной, домовой, призраки и чародеи разных мастей.
Tom is a lifeguard at the local swimming pool.
Том — охранник в местном бассейне.
She works at the local flower shop.
Она работает в местном цветочном магазине.
The local government outlawed the production of alcoholic beverages.
Местное правительство объявило производство алкогольных напитков незаконным.
Mary works at a local hospital.
Мэри работает в местной больнице.
When you travel, you’ve got to try the local brew.
Когда вы путешествуете, вы должны попробовать местного пива.
The local restaurant is awful.
Тамошний ресторан ужасен.
He writes articles for the local newspaper.
Он пишет статьи для местной газеты.
%d0%b0%d0%bd%d0%b5%d1%81%d1%82%d0%b5%d0%b7%d0%b8%d0%bd — со всех языков на все языки
Все языкиАбхазскийАдыгейскийАфрикаансАйнский языкАканАлтайскийАрагонскийАрабскийАстурийскийАймараАзербайджанскийБашкирскийБагобоБелорусскийБолгарскийТибетскийБурятскийКаталанскийЧеченскийШорскийЧерокиШайенскогоКриЧешскийКрымскотатарскийЦерковнославянский (Старославянский)ЧувашскийВаллийскийДатскийНемецкийДолганскийГреческийАнглийскийЭсперантоИспанскийЭстонскийБаскскийЭвенкийскийПерсидскийФинскийФарерскийФранцузскийИрландскийГэльскийГуараниКлингонскийЭльзасскийИвритХиндиХорватскийВерхнелужицкийГаитянскийВенгерскийАрмянскийИндонезийскийИнупиакИнгушскийИсландскийИтальянскийЯпонскийГрузинскийКарачаевскийЧеркесскийКазахскийКхмерскийКорейскийКумыкскийКурдскийКомиКиргизскийЛатинскийЛюксембургскийСефардскийЛингалаЛитовскийЛатышскийМаньчжурскийМикенскийМокшанскийМаориМарийскийМакедонскийКомиМонгольскийМалайскийМайяЭрзянскийНидерландскийНорвежскийНауатльОрокскийНогайскийОсетинскийОсманскийПенджабскийПалиПольскийПапьяментоДревнерусский языкПортугальскийКечуаКвеньяРумынский, МолдавскийАрумынскийРусскийСанскритСеверносаамскийЯкутскийСловацкийСловенскийАлбанскийСербскийШведскийСуахилиШумерскийСилезскийТофаларскийТаджикскийТайскийТуркменскийТагальскийТурецкийТатарскийТувинскийТвиУдмурдскийУйгурскийУкраинскийУрдуУрумскийУзбекскийВьетнамскийВепсскийВарайскийЮпийскийИдишЙорубаКитайский
определение, произношение, транскрипция, словоформы, примеры
существительное
— общественный транспорт, состоящий из автобуса или поезда, который останавливается на всех станциях или остановках местному жителю, казалось, потребовалась целая вечность, чтобы добраться до Нью-Йорка
прилагательное
— относящийся к или применимые или связанные с администрацией города или поселка или района, а не более крупной территории местные налоги
местные органы власти
местные обычаи
местные школы
местные граждане
местная точка зрения
местные вспышки гриппа
местный автобус
местная анестезия
Дополнительные примеры
Мы ужинали в местном ресторане.
За преступление полиция арестовала местного жителя.
Это местный магазинчик для местных: у нас здесь не так много посторонних.
Она села на местный автобус.
Он президент профсоюза местных жителей на заводе.
Так местные жители называют озеро.
Мы попросили одного из местных порекомендовать ресторан.
Я обычно пью пинту или две в моем местном ресторане по вечерам в пятницу.
Местный звонок стоит меньше, чем междугородний или международный звонок.
Местная газета информирует людей о том, что происходит в городе.
На веб-сайте представлена информация о местных мероприятиях.
Веб-сайт предоставляет пользователям информацию о местных мероприятиях.
Водители грузовиков являются членами местного отделения 349 Союза водителей
.Оба они начали свою карьеру в местной газете.
Местные власти расследуют происшествие.
Формы слова
единственное число: местное
множественное число: местные
Локальная и глобальная регуляция инициации транскрипции у бактерий
Browning, D.Ф. и Басби, С. Дж. Регулирование инициации бактериальной транскрипции. Nat. Rev. Microbiol. 2 , 57–65 (2004).
CAS PubMed Google ученый
Феклистов А., Шарон Б. Д., Дарст С. А. и Гросс С. А. Бактериальные сигма-факторы: историческая, структурная и геномная перспектива. Annu. Rev. Microbiol. 68 , 357–376 (2014).
CAS PubMed Google ученый
Мураками, К.С. и Дарст, С. А. Бактериальные РНК-полимеразы: полная история. Curr. Opin. Struct. Биол. 13 , 31–39 (2003).
CAS PubMed Google ученый
Феклистов А. и Дарст С. А. Структурные основы распознавания промотора -10 элемента сигма-субъединицей бактериальной РНК-полимеразы. Cell 147 , 1257–1269 (2011).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Чжан Ю.и другие. Структурные основы инициации транскрипции. Наука 338 , 1076–1080 (2012). Эта работа дополняет предыдущую структурную работу, подробно описанную в ссылке 3, путем выявления взаимодействий бактериального голофермента, содержащего σ 70 , с нижним концом инициирующего «пузыря». Результаты знакомят нас с разделением определенных оснований и их вставкой в карманы в сигма-факторе, а также с конкретными взаимодействиями между боковыми цепями в ядре фермента и некоторыми основаниями рядом с началом транскрипта (элемент распознавания ядра (CRE)).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Zuo, Y. & Steitz, T. A. Кристаллические структуры комплексов инициации транскрипции
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Бэ, Б., Феклистов, А., Ласс-Напорковска, А., Landick, R. & Darst, S.A. Структура комплекса открытого промотора холофермента бактериальной РНК-полимеразы. eLife 4 , e08504 (2015).
PubMed Central Google ученый
Рафф Э. Ф., Рекорд М. Т. и Арцимович И. Начальные события в инициации бактериальной транскрипции. Биомолекулы 5 , 1035–1062 (2015).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Уошберн, Р.S. & Gottesman, M. E. Регулирование удлинения и окончания транскрипции. Биомолекулы 5 , 1063–1078 (2015).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Робертс, Дж. У., Шанкар, С. и Фильтр, Дж. Дж. Факторы удлинения РНК-полимеразы. Annu. Rev. Microbiol. 62 , 211–233 (2008).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Чжан Дж.И Ландик Р. Улица с двусторонним движением: регуляторное взаимодействие между РНК-полимеразой и зарождающейся структурой РНК. Trends Biochem. Sci. 41 , 293–310 (2016).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Кэмпбелл, Э. А. и др. Структура сигма-субъединицы специфичности промотора бактериальной РНК-полимеразы. Мол. Ячейка 9 , 527–539 (2002).
CAS PubMed Google ученый
Меклер В.и другие. Структурная организация холофермента бактериальной РНК-полимеразы и открытого комплекса РНК-полимераза – промотор. Cell 108 , 599–614 (2002).
CAS PubMed Google ученый
Bae, B. et al. Ингибирование фагом T7 Gp2 РНК-полимеразы Escherichia coli включает незаконное присвоение домена 1.1 σ70. Proc. Natl Acad. Sci. США 110 , 19772–19777 (2013).
CAS PubMed Google ученый
Мураками, К.S. Рентгеновская кристаллическая структура холофермента РНК-полимеразы Escherichia coli σ70. J. Biol. Chem. 288 , 9126–9134 (2013).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Грубер, Т. М. и Гросс, К. А. Множественные сигма-субъединицы и разделение бактериального транскрипционного пространства. Annu. Rev. Microbiol. 57 , 441–466 (2003).
CAS PubMed Google ученый
Мураками, К.С., Масуда, С., Кэмпбелл, Э. А., Маззин, О. и Дарст, С. А. Структурная основа инициации транскрипции: комплекс холофермент-ДНК РНК-полимеразы. Наука 296 , 1285–1290 (2002).
CAS PubMed Google ученый
Васылев Д.Г. и др. Кристаллическая структура холофермента бактериальной РНК-полимеразы при разрешении 2,6 Å. Природа 417 , 712–719 (2002).
CAS PubMed Google ученый
Янг Ю.и другие. Структуры РНК-полимеразы-σ54 обнаруживают новые консервативные регуляторные стратегии. Наука 349 , 882–885 (2015). В этой статье представлена долгожданная структура σ 54 и ее взаимодействия с РНК-полимеразой. Структура показывает, насколько σ 54 действительно отличается от σ 70 , почему он неспособен к инициации транскрипции, и предлагает, как могут работать его активаторы.
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Jishage, M. & Ishihama, A. Регулирование синтеза сигма-субъединицы РНК-полимеразы в Escherichia coli : внутриклеточные уровни σ70 и σ38. J. Bacteriol. 177 , 6832–6835 (1995).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Джишаге, М., Ивата, А., Уэда, С. и Исихама, А. Регулирование синтеза сигма-субъединицы РНК-полимеразы в Escherichia coli : внутриклеточные уровни четырех видов сигма-субъединицы в различных условиях роста. J. Bacteriol. 178 , 5447–5451 (1996).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Маеда, Х., Фуджита, Н. и Исихама, А. Конкуренция между семью сигма-субъединицами Escherichia coli : относительное сродство связывания с основной РНК-полимеразой. Nucleic Acids Res. 28 , 3497–3503 (2000).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Кэмпбелл, Э. А., Вестблэйд, Л. Ф. и Дарст, С. А. Регулирование активности бактериального РНК-полимеразного фактора сигма: структурная перспектива. Curr. Opin. Microbiol. 11 , 121–127 (2008).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Родиус, В.A. et al. Дизайн ортогональных генетических переключателей на основе карты перекрестных помех сигм, антисигм и промоторов. Мол. Syst. Биол. 9 , 702 (2013).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Campagne, S., Marsh, M. E., Capitani, G., Vorholt, J. A. & Allain, F.H. Структурная основа плавления -10 промоторного элемента под воздействием сигма-факторов, индуцированных окружающей средой. Nat. Struct. Мол.Биол. 21 , 269–276 (2014).
CAS PubMed Google ученый
Ку, Б. М., Родиус, В. А., Нонака, Г., де Хасет, П. Л. и Гросс, К. А. Сниженная способность альтернативных сигм плавить промоторы обеспечивает строгое распознавание промоторов. Genes Dev. 23 , 2426–2436 (2009).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Холландс, К., Lee, D. J., Lloyd, G. S. и Busby, S. J. Активация σ28-зависимой транскрипции в Escherichia coli белком циклического рецептора AMP требует необычной организации промотора. Мол. Microbiol. 75 , 1098–1111 (2010).
CAS PubMed Google ученый
Пэджет, М.С. Бактериальные сигма-факторы и антисигма-факторы: структура, функция и распределение. Биомолекулы 5 , 1245–1265 (2015).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Остерберг С., дель Песо-Сантос Т. и Шинглер В. Регулирование использования альтернативного сигма-фактора. Annu. Rev. Microbiol. 65 , 37–55 (2011).
PubMed Google ученый
Francez-Charlot, A. et al. Мимикрия сигма-фактора участвует в регуляции общей стрессовой реакции. Proc. Natl Acad. Sci. США 106 , 3467–3472 (2009). После разрешения структур сигма-антисигма комплексов, подробно описанных в ссылке 23, эта статья сообщает, что анти-антисигма фактор может функционировать, имитируя сигма-фактор. Хотя это было предсказуемо, его формальная демонстрация стала вехой для этой области.
CAS PubMed Google ученый
Herrou, J., Ротскофф, Г., Луо, Й., Ру, Б., Кроссон, С. Структурная основа переключения белкового партнера, который регулирует общий стрессовый ответ α-протеобактерий. Proc. Natl Acad. Sci. США 109 , E1415 – E1423 (2012).
CAS PubMed Google ученый
Typas, A., Barembruch, C., Possling, A. & Hengge, R. Стационарная фазовая реорганизация транскрипционного аппарата Escherichia coli с помощью белка Crl, точного регулятора активности и уровней сигмы. EMBO J. 26 , 1569–1578 (2007).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Banta, A. B. et al. Ключевые особенности σS, необходимые для специфического распознавания Crl, фактора транскрипции, способствующего сборке холофермента РНК-полимеразы. Proc. Natl Acad. Sci. США 110 , 15955–15960 (2013).
CAS PubMed Google ученый
Банта, А.B. et al. Структура фактора сборки РНК-полимеразы Crl и идентификация его поверхности взаимодействия с σS. J. Bacteriol. 196 , 3279–3288 (2014).
PubMed PubMed Central Google ученый
Юань, А. Х. и др. Белки семейства Rsd одновременно взаимодействуют с областями 2 и 4 первичного сигма-фактора. Мол. Microbiol. 70 , 1136–1151 (2008).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Пайпер, С.Э., Митчелл, Дж. Э., Ли, Д. Дж. И Басби, С. Дж. Общий взгляд на белок Escherichia coli Rsd и его взаимодействия. Мол. Биосист. 5 , 1943–1947 (2009).
CAS PubMed Google ученый
Шарма, У. К. и Чаттерджи, Д. Переключение транскрипции в Escherichia coli во время стресса и голодания путем модуляции активности σ 70 . FEMS Microbiol.Ред. 34 , 646–657 (2010).
CAS PubMed Google ученый
Jishage, M., Kvint, K., Shingler, V. & Nystrom, T. Регулирование конкуренции сигма-факторов с помощью alarmone ppGpp. Genes Dev. 16 , 1260–1270 (2002).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Костанцо, А. и др. ppGpp и DksA, вероятно, регулируют активность внецитоплазматического стрессового фактора σE в Escherichia coli как прямыми, так и косвенными механизмами. Мол. Microbiol. 67 , 619–632 (2008).
CAS PubMed Google ученый
Merrick, M. J. В собственном классе — сигма-фактор РНК-полимеразы σ54 (σN). Мол. Microbiol. 10 , 903–909 (1993).
CAS PubMed Google ученый
Studholme, D. J. & Buck, M. Биология энхансер-зависимой регуляции транскрипции у бактерий: понимание последовательностей генома. FEMS Microbiol. Lett. 186 , 1–9 (2000).
CAS PubMed Google ученый
Wigneshweraraj, S. et al. Modus operandi бактериальной РНК-полимеразы, содержащей фактор специфичности промотора σ54. Мол. Microbiol. 68 , 538–546 (2008).
CAS PubMed Google ученый
Фленти, К., Гарнер, А. Л. и Сталлингс, К. Л. Аппарат транскрипции Mycobacterium tuberculosis : готов ответить на атаки хозяина. J. Bacteriol. 198 , 1360–1373 (2016).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Hubin, E.A. et al. Структурный, функциональный и генетический анализ актинобактериального фактора транскрипции RbpA. Proc. Natl Acad. Sci. США 112 , 7171–7176 (2015).
CAS PubMed Google ученый
Srivastava, D. B. et al. Структура и функция CarD, важного фактора транскрипции микобактерий. Proc. Natl Acad. Sci. США 110 , 12619–12624 (2013).
CAS PubMed Google ученый
Bae, B. et al. CarD использует механизм клина малой бороздки для стабилизации комплекса открытого промотора РНК-полимеразы. eLife 4 , e08505 (2015).
PubMed Central Google ученый
Передерина А. и др. Регуляция через вторичный канал — структурный каркас для синергизма ppGpp – DksA во время транскрипции. Cell 118 , 297–309 (2004).
CAS PubMed Google ученый
Paul, B.J. et al. DksA: критический компонент механизма инициации транскрипции, который усиливает регуляцию промоторов рРНК с помощью ppGpp и инициирующего NTP. Cell 118 , 311–322 (2004).
CAS PubMed Google ученый
Пол, Б. Дж., Беркмен, М. Б. и Гурс, Р. Л. DksA потенцирует прямую активацию аминокислотных промоторов с помощью ppGpp. Proc. Natl Acad. Sci. США 102 , 7823–7828 (2005). В этом исследовании используется анализ in vitro , чтобы предоставить доказательство того, что ppGpp вместе с DksA действительно может напрямую стимулировать инициацию транскрипции на промоторе.Эта статья представляет собой прекрасный урок того, как ограничения генетики могут быть устранены с помощью удивительной биохимии.
CAS PubMed Google ученый
Леннон, К. В. и др. Прямые взаимодействия между кончиком спиральной спирали DksA и триггерной петлей РНК-полимеразы опосредуют регуляцию транскрипции. Genes Dev. 26 , 2634–2646 (2012).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Росс, W., Vrentas, C.E., Sanchez-Vazquez, P., Gaal, T. и Gourse, R.L. Волшебное пятно: сайт связывания ppGpp на РНК-полимеразе E. coli , ответственной за регуляцию инициации транскрипции. Мол. Ячейка 50 , 420–429 (2013).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Хаурилюк В., Аткинсон Г. К., Мураками К. С., Тенсон Т. и Гердес К. Недавние функциональные исследования роли (p) ppGpp в бактериальной физиологии. Nat. Rev. Microbiol. 13 , 298–309 (2015).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Зенкин Н. и Юзенкова Ю. Новое понимание функций факторов транскрипции, которые связывают вторичный канал РНК-полимеразы. Биомолекулы 5 , 1195–1209 (2015).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Юзенкова Ю., Роганян М. и Зенкин Н. Множественные активные центры мультисубъединичных РНК-полимераз. Транскрипция 3 , 115–118 (2012).
PubMed PubMed Central Google ученый
Фридман, Л. Дж. И Геллес, Дж. Многоволновой флуоресцентный анализ механизмов транскрипции с помощью одной молекулы. Методы 86 , 27–36 (2015).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Чжан Ю.и другие. DksA защищает удлиняющуюся РНК-полимеразу от остановки, вызванной остановкой рибосом. Мол. Ячейка 53 , 766–778 (2014).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Кавана, А. Т. и Вассарман, К. М. 6S РНК, глобальный регулятор транскрипции в Escherichia coli. Bacillus subtilis и не только. Annu. Rev. Microbiol. 68 , 45–60 (2014).
CAS PubMed Google ученый
Лю Б.и другие. Регулятор транскрипции бактериофага подавляет инициацию бактериальной транскрипции за счет замещения сигма-фактора. Nucleic Acids Res. 42 , 4294–4305 (2014).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Lambert, LJ, Wei, Y., Schirf, V., Demeler, B. & Werner, MH T4 AsiA блокирует распознавание ДНК путем ремоделирования области σ70 4. EMBO J. 23 , 2952–2962 (2004).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Gregory, B.D. et al. Регулятор, который ингибирует транскрипцию, воздействуя на межсубъединичное взаимодействие холофермента РНК-полимеразы. Proc. Natl Acad. Sci. США 101 , 4554–4559 (2004).
CAS PubMed Google ученый
Хинтон, Д. М. Контроль транскрипции в пререпликативной фазе развития Т4. Virol. J. 7 , 289 (2010).
PubMed PubMed Central Google ученый
Гриффит, К.Л., Шах, И.М., Майерс, Т.Э., О’Нил, М.С. и Вольф, Р.Э. Доказательства «предварительного набора» как нового механизма активации транскрипции в Escherichia coli : большой избыток Сайтов связывания SoxS на клетку относительно количества молекул SoxS на клетку. Biochem. Биофиз. Res. Commun. 291 , 979–986 (2002).
CAS PubMed Google ученый
Shah, IM & Wolf, RE Новое белок-белковое взаимодействие между Escherichia coli SoxS и детерминантой связывания ДНК α-субъединицы РНК-полимеразы: SoxS функционирует как ко-сигма-фактор и повторно использует РНК-полимеразу из UP -элементсодержащие промоторы к SoxS-зависимым промоторам во время окислительного стресса. J. Mol.Биол. 343 , 513–532 (2004).
CAS PubMed Google ученый
Зубер П. Управление окислительным стрессом у Bacillus . Annu. Rev. Microbiol. 63 , 575–597 (2009).
CAS PubMed Google ученый
Ньюберри, К.Дж., Накано, С., Зубер, П. и Бреннан, Р.Г. Кристаллическая структура глобального регулятора транскрипции Spx Bacillus subtilis против альфа, глобального регулятора транскрипции, Spx, в комплексе с α C-концевым доменом РНК-полимераза. Proc. Natl Acad. Sci. США 102 , 15839–15844 (2005).
CAS PubMed Google ученый
Ламур, В., Вестблэйд, Л. Ф., Кэмпбелл, Э. А. и Дарст, С. А. Кристаллическая структура комплекса in vivo, собранного Bacillus subtilis Spx / РНК-полимераза α-субъединицы С-концевого домена. J. Struct. Биол. 168 , 352–356 (2009).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Mangel, W.Ф. и Чемберлин, М. Дж. Исследования инициации цепи рибонуклеиновой кислоты с помощью полимеразы рибонуклеиновой кислоты Escherichia coli , связанной с дезоксирибонуклеиновой кислотой Т7. I. Анализ скорости и степени инициации цепи рибонуклеиновой кислоты. J. Biol. Chem. 249 , 2995–3001 (1974).
CAS PubMed Google ученый
Мюррей, Х. Д., Шнайдер, Д. А. и Гурс, Р. Л. Контроль экспрессии рРНК малыми молекулами является динамичным и неизбыточным. Мол. Ячейка 12 , 125–134 (2003).
CAS PubMed Google ученый
Schneider, D. A., Gaal, T. & Gourse, R. L. Зондирование NTP промоторами рРНК в Escherichia coli является прямым. Proc. Natl Acad. Sci. США 99 , 8602–8607 (2002).
CAS PubMed Google ученый
Красный, Л.И Гурс Р. Л. Альтернативная стратегия синтеза бактериальных рибосом: регуляция транскрипции рРНК Bacillus subtilis . EMBO J. 23 , 4473–4483 (2004).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Лю К., Биттнер А. Н. и Ван Дж. Д. Разнообразие в (p) метаболизме и эффекторах ppGpp. Curr. Opin. Microbiol. 24 , 72–79 (2015). Это исследование дает очень четкое представление о том, как ppGpp (и pppGpp) играет разные роли в разных бактериях.Предупреждение о том, что то, что верно для E. coli , может быть неверным для других бактерий, не говоря уже о слонах.
PubMed PubMed Central Google ученый
Тернбоу, К. Л. и Свитцер, Р. Л. Регулирование экспрессии гена биосинтеза пиримидина в бактериях: репрессия без репрессоров. Microbiol. Мол. Биол. Ред. 72 , 266–300 (2008).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Мартинес-Антонио, А.И Колладо-Видес, Дж. Идентификация глобальных регуляторов в сетях регуляции транскрипции у бактерий. Curr. Opin. Microbiol. 6 , 482–489 (2003).
CAS PubMed Google ученый
Исихама, А. Регулирование генома прокариот: революционная парадигма. Proc. Jpn Acad. Сер. B Phys. Биол. Sci. 88 , 485–508 (2012).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Чо, Б.К., Палссон, Б. и Зенглер, К. Расшифровка регуляторных кодов в бактериальных геномах. Biotechnol. J. 6 , 1052–1063 (2011).
CAS PubMed Google ученый
Salgado, H. et al. Извлечение регуляторных сетей Escherichia coli из RegulonDB. Methods Mol. Биол. 804 , 179–195 (2012).
CAS PubMed Google ученый
Диллон, С.C. & Dorman, C.J. Бактериальные нуклеоид-ассоциированные белки, структура нуклеоидов и экспрессия генов. Nat. Rev. Microbiol. 8 , 185–195 (2010).
CAS PubMed Google ученый
Али Азам, Т., Ивата, А., Нишимура, А., Уэда, С. и Исихама, А. Изменение белкового состава нуклеоида Escherichia coli , зависящее от фазы роста. J. Bacteriol. 181 , 6361–6370 (1999).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Азам Т. А. и Исихама А. Двенадцать видов нуклеоид-ассоциированного белка из Escherichia coli . Специфичность распознавания последовательностей и аффинность связывания ДНК. J. Biol. Chem. 274 , 33105–33113 (1999).
CAS PubMed Google ученый
Люйстербург, М.С., Ноом, М. С., Вуйт, Г. Дж. И Дэйм, Р. Т. Архитектурная роль нуклеоид-ассоциированных белков в организации бактериального хроматина: молекулярная перспектива. J. Struct. Биол. 156 , 262–272 (2006).
CAS PubMed Google ученый
Браунинг, Д. Ф., Грейнджер, Д. С. и Басби, С. Дж. Влияние нуклеоид-ассоциированных белков на структуру бактериальных хромосом и экспрессию генов. Curr. Opin. Microbiol. 13 , 773–780 (2010).
CAS PubMed Google ученый
Грейнджер, Д. К., Голдберг, М. Д., Ли, Д. Дж. И Басби, С. Дж. Селективная репрессия с помощью Fis и H-NS на промоторе Escherichia coli dps . Мол. Microbiol. 68 , 1366–1377 (2008).
CAS PubMed Google ученый
Собецко, П., Глинковска, М., Траверс, А., Мусхелишвили, Г. Термодинамическая стабильность ДНК и динамика суперспирали определяют программу экспрессии генов во время цикла роста бактерий. Мол. Биосист. 9 , 1643–1651 (2013).
CAS PubMed Google ученый
Собецко П., Траверс А. и Мусхелишвили Г. Порядок генов и динамика хромосом координируют пространственно-временную экспрессию генов во время цикла роста бактерий. Proc. Natl Acad. Sci. США 109 , E42 – E50 (2012).
CAS PubMed Google ученый
Дорман, К. Дж. Совместная роль суперспирали ДНК и белков, связанных с нуклеоидами, в регуляции бактериальной транскрипции. Biochem. Soc. Пер. 41 , 542–547 (2013).
CAS PubMed Google ученый
Чжан, В.И Басеман, Дж. Б. Регуляция транскрипции MG_149, гена осмоиндуцируемого липопротеина из Mycoplasma genitalium . Мол. Microbiol. 81 , 327–339 (2011).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Neumann, S. & Quinones, A. Дискоординатная экспрессия генов gyrA и gyrB в ответ на ингибирование ДНК-гиразы в Escherichia coli . J. Basic Microbiol. 37 , 53–69 (1997).
CAS PubMed Google ученый
Lal, A. et al. Геномные масштабы суперспирализации в бактериальной хромосоме. Nat. Commun. 7 , 11055 (2016).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Брайант, Дж. А., Селларс, Л. Е., Басби, С. Дж.И Ли, Д. Дж. Влияние положения хромосомы на экспрессию генов в Escherichia coli K-12. Nucleic Acids Res. 42 , 11383–11392 (2014).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Суинт-Круз, Л. и Мэтьюз, К. С. Аллостери в семье LacI / GalR: вариации на тему. Curr. Opin. Microbiol. 12 , 129–137 (2009).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Семсей, С., Толсторуков, М. Ю., Вирник, К., Журкин, В. Б., Адхья, С. Траектория ДНК в репрессосоме Gal. Genes Dev. 18 , 1898–1907 (2004).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Butala, M. et al. Двойная блокировка промотора Escherichia coli двумя репрессорами предотвращает преждевременную экспрессию колицина и лизис клеток. Мол. Microbiol. 86 , 129–139 (2012).
CAS PubMed Google ученый
Kamensek, S. et al. Подавление экспрессии гена колицина Е8 ДНКазой за счет сложной сборки нуклеопротеидов обеспечивает своевременную индукцию колицина. PLoS Genet. 11 , e1005354 (2015).
PubMed PubMed Central Google ученый
Валентин-Хансен, П., Согаард-Андерсен, Л. и Педерсен, Х.Гибкое партнерство: антиактиватор CytR и белок активатора цАМФ – CRP, товарищи по контролю транскрипции. Мол. Microbiol. 20 , 461–466 (1996).
CAS PubMed Google ученый
Monsalve, M., Mencia, M., Salas, M. & Rojo, F. Белок p4 репрессирует промотор фага Φ29 A2c путем взаимодействия с α-субъединицей РНК-полимеразы Bacillus subtilis . Proc. Natl Acad.Sci. USA 93 , 8913–8918 (1996).
CAS PubMed Google ученый
Ли Д. Дж., Минчин С. Д. и Басби С. Дж. Активация транскрипции в бактериях. Annu. Rev. Microbiol. 66 , 125–152 (2012).
CAS PubMed Google ученый
Benoff, B. et al. Структурная основа активации транскрипции: комплекс CAP – αCTD – ДНК. Наука 297 , 1562–1566 (2002).
CAS PubMed Google ученый
Gaston, K., Bell, A., Kolb, A., Buc, H., Busby, S. Строгие требования к интервалам для активации транскрипции с помощью CRP. Cell 62 , 733–743 (1990).
CAS PubMed Google ученый
Чжоу, Ю., Колб, А., Басби, С. Дж.& Wang, Y. P. Требования к пространству для активации транскрипции класса I в бактериях устанавливаются промоторными элементами. Nucleic Acids Res. 42 , 9209–9216 (2014).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Дав, С. Л., Хуанг, Ф. В. и Хохшильд, А. Механизм активатора транскрипции, который работает на стадии изомеризации. Proc. Natl Acad. Sci. USA 97 , 13215–13220 (2000).
CAS PubMed Google ученый
Джайн Д., Никелс Б. Э., Сан Л., Хохшильд А. и Дарст С. А. Структура тройного комплекса активации транскрипции. Мол. Ячейка 13 , 45–53 (2004).
CAS PubMed Google ученый
Niu, W., Kim, Y., Tau, G., Heyduk, T. и Ebright, R.H. Активация транскрипции на CAP-зависимых промоторах класса II: два взаимодействия между CAP и РНК-полимеразой. Cell 87 , 1123–1134 (1996).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Фэн Ю., Чжан Ю. и Эбрайт Р. Х. Структурные основы активации транскрипции. Наука 352 , 1330–1333 (2016). Эта статья описывает первую полную молекулярную картину активации транскрипции класса II на промоторе-мишени и контрастирует с предыдущими сообщениями, в которых описаны компоненты процесса.
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Браун Н. Л., Стоянов Дж. В., Кидд С. П. и Хобман Дж. Л. Семейство транскрипционных регуляторов MerR. FEMS Microbiol. Ред. 27 , 145–163 (2003).
CAS PubMed Google ученый
Philips, S. J. et al. Аллостерическая регуляция транскрипции через изменения общей топологии корового промотора. Наука 349 , 877–881 (2015). Работая с CueR, который воспринимает ионы меди и серебра, в этой статье представлены структуры его комплексов с высоким разрешением в целевой последовательности в режиме активатора или репрессора. Результаты дополняют предыдущую работу, подробно описанную в ссылке 106, показывая, что искажение ДНК такими факторами неравномерно.
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Heldwein, E.E. & Brennan, R.G. Кристаллическая структура активатора транскрипции BmrR, связанного с ДНК и лекарством. Природа 409 , 378–382 (2001).
CAS PubMed Google ученый
Бустаманте, В. Х., Сантана, Ф. Дж., Кальва, Э. и Пуэнте, Дж. Л. Регуляция транскрипции генов секреции типа III в энтеропатогенных Escherichia coli : Ler противодействует H-NS-зависимой репрессии. Мол.Microbiol. 39 , 664–678 (2001).
CAS PubMed Google ученый
Сперандио, В. и др. Активация энтеропатогенных оперонов Escherichia coli (EPEC) LEE2 и LEE3 по Леру. Мол. Microbiol. 38 , 781–793 (2000).
CAS PubMed Google ученый
Браунинг, Д.Ф., Коул, Дж. А. и Басби, С. Дж. Активация транскрипции путем ремоделирования сборки нуклеопротеидов: роль NarL на FNR-зависимом промоторе Escherichia coli nir . Мол. Microbiol. 53 , 203–215 (2004).
CAS PubMed Google ученый
Browning, D. F., Cole, J. A. и Busby, S. J. Регулирование нуклеоид-ассоциированными белками на промоторе оперона Escherichia coli nir . J. Bacteriol. 190 , 7258–7267 (2008).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Тайсон, К. Л., Коул, Дж. А. и Басби, С. Дж. Регулирование нитритов и нитратов на промоторах двух оперонов Escherichia coli , кодирующих нитритредуктазу: идентификация общих целевых гептамеров как для NarP-, так и для NarL-зависимой регуляции. Мол. Microbiol. 13 , 1045–1055 (1994).
CAS PubMed Google ученый
Буш М. и Диксон Р. Роль бактериальных белков, связывающих энхансеры, как специализированных активаторов σ54-зависимой транскрипции. Microbiol. Мол. Биол. Ред. 76 , 497–529 (2012).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Buck, M. et al. Вторая парадигма активации генов у бактерий. Biochem. Soc. Пер. 34 , 1067–1071 (2006).
CAS PubMed Google ученый
Casadesus, J. & Low, D. Эпигенетическая регуляция генов в бактериальном мире. Microbiol. Мол. Биол. Ред. 70 , 830–856 (2006).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
van der Woude, M. W.И Хендерсон, И. Р. Регулирование и функция Ag43 (грипп). Annu. Rev. Microbiol. 62 , 153–169 (2008).
CAS PubMed Google ученый
Санчес-Ромеро, М. А., Кота, И. и Касадесус, Дж. Метилирование ДНК у бактерий: от метильной группы к метилому. Curr. Opin. Microbiol. 25 , 9–16 (2015).
CAS PubMed Google ученый
van der Woude, M.W. & Baumler, A.J. Фаза и антигенная изменчивость у бактерий. Clin. Microbiol. Ред. 17 , 581–611 (2004).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
van der Woude, M. W. Фазовое изменение: как создать и координировать популяционное разнообразие. Curr. Opin. Microbiol. 14 , 205–211 (2011).
CAS PubMed Google ученый
Cerdeno-Tarraga, A.M. et al. Обширные инверсии ДНК в геноме B. fragilis контролируют экспрессию вариабельных генов. Наука 307 , 1463–1465 (2005).
CAS PubMed Google ученый
Moxon, R., Bayliss, C. & Hood, D. Локусы контингентности бактерий: роль повторов простой последовательности ДНК в бактериальной адаптации. Annu. Преподобный Жене. 40 , 307–333 (2006).
CAS PubMed Google ученый
Джейкоб, Ф.Эволюция и возня. Наука 196 , 1161–1166 (1977).
CAS PubMed Google ученый
Уэйд, Дж. Т. и Грейнджер, Д. С. Повсеместная транскрипция: освещение темной материи бактериальных транскриптомов. Nat. Rev. Microbiol. 12 , 647–653 (2014).
CAS PubMed Google ученый
Громанн, Д.И Вернер Ф. Последние достижения в понимании архейной транскрипции. Curr. Opin. Microbiol. 14 , 328–334 (2011).
CAS PubMed Google ученый
Висвесвариа, С. и Басби, С. Дж. Эволюция бактериальных факторов транскрипции: как белки берут на себя новые задачи, но не всегда перестают выполнять старые. Trends Microbiol. 23 , 463–467 (2015).
CAS PubMed Google ученый
Грейнджер Д.К., Херд, Д., Харрисон, М., Холдсток, Дж. И Басби, С. Дж. Исследования распределения белка цАМФ-рецептора Escherichia coli и РНК-полимеразы вдоль хромосомы E. coli . Proc. Natl Acad. Sci. США 102 , 17693–17698 (2005).
CAS PubMed Google ученый
Шимада, Т., Исихама, А., Басби, С. Дж. И Грейнджер, Д. С. Фактор транскрипции Escherichia coli RutR связывается с мишенями внутри генов, а также с межгенными областями. Nucleic Acids Res. 36 , 3950–3955 (2008).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Aiyar, S.E. et al. Архитектура Fis-активированных транскрипционных комплексов на промоторах rrnB P1 и rrnE P1 Escherichia coli. J. Mol. Биол. 316 , 501–516 (2002).
CAS PubMed Google ученый
Росситер, А.E. et al. Экспрессия различных бактериальных цитотоксинов контролируется двумя глобальными факторами транскрипции, CRP и Fis, которые взаимодействуют в механизме совместного рекрутирования. Biochem. J. 466 , 323–335 (2015).
CAS PubMed Google ученый
Lisser, S. & Margalit, H. Компиляция последовательностей промотора мРНК E. coli . Nucleic Acids Res. 21 , 1507–1516 (1993).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Хук-Барнард, И. Г. и Хинтон, Д. М. Инициирование транскрипции с помощью элементов смешивания и сопоставления: гибкость связывания полимеразы с бактериальными промоторами. Gene Regul. Syst. Био 1 , 275–293 (2007).
PubMed PubMed Central Google ученый
Росс, В., Эрнст, А.И Гурс, Р. Л. Тонкая структура взаимодействий E. coli РНК-полимераза -промотор: связывание α-субъединицы с малой бороздкой UP-элемента. Genes Dev. 15 , 491–506 (2001).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Sclavi, B. et al. Характеристика в реальном времени промежуточных продуктов на пути к образованию открытых комплексов с помощью РНК-полимеразы Escherichia coli на промоторе T7A1. Proc. Natl Acad. Sci. США 102 , 4706–4711 (2005).
CAS PubMed Google ученый
Дэвис, К. А., Бингман, К. А., Ландик, Р., Рекорд, М. Т. и Сэккер, Р. М. Постановка следа ДНК в реальном времени в первом кинетически значимом промежуточном продукте в образовании открытого комплекса с помощью РНК-полимеразы Escherichia coli . Proc. Natl Acad. Sci. США 104 , 7833–7838 (2007).
CAS PubMed Google ученый
Бакл М., Пембертон И. К., Жаке М. А. и Бук Х. Кинетика распознавания промотора, направленного на сигма-субъединицу, с помощью РНК-полимеразы E. coli . J. Mol. Биол. 285 , 955–964 (1999).
CAS PubMed Google ученый
Stracy, M. et al. Микроскопия сверхразрешения живых клеток показывает организацию РНК-полимеразы в бактериальном нуклеоиде. Proc. Natl Acad. Sci. США 112 , E4390 – E4399 (2015). Это исследование показывает, что живую микроскопию можно использовать для наблюдения отдельных молекул РНК-полимеразы в E. coli . Это предварительное условие для будущего прямого наблюдения за реакциями на регуляторные триггеры.
CAS PubMed Google ученый
Патрик М., Деннис П. П., Эренберг М. и Бремер Х.Свободная РНК-полимераза в E. coli . Biochimie 119 , 80–91 (2015).
CAS PubMed Google ученый
Hsu, L. M. Побег промотора с помощью РНК-полимеразы Escherichia coli . EcoSal Plus http://dx.doi.org/10.1128/ecosalplus.4.5.2.2 (2008 г.).
Сканке, Дж., Бар, Н., Койпер, М. и Хсу, Л. М. Зависимая от последовательности эффективность ускользания промотора сильно зависит от предвзятости к предварительно перемещенному состоянию во время начальной транскрипции. Биохимия 54 , 4267–4275 (2015).
CAS PubMed Google ученый
Bauer, D. L. V., Duchi, D. & Kapanidis, A. N. E. coli РНК-полимераза приостанавливается во время начальной транскрипции. Biophys. J. 110 (Приложение 1), 21a (2016).
Google ученый
Реппас, Н. Б., Уэйд, Дж. Т., Черч, Г.M. & Struhl, K. Переход между инициацией транскрипции и элонгацией в E. coli очень вариабелен и часто ограничивает скорость. Мол. Ячейка 24 , 747–757 (2006).
CAS PubMed Google ученый
Сэнди, Б., Ли, Д. Дж., Басби, С. Дж. И Брайант, Дж. А. Поставка и прохождение РНК-полимеразы через lac-оперон в Escherichia coli . Philos. Пер. R. Soc.Лондон. B. Biol. Sci. (в печати).
Jacob, F. La Statue Intérieure (на французском языке) (Éditions Odile Jacob, 1987).
Google ученый
Мюллер-Хилл, Б. Лак Оперон. Краткая история генетической парадигмы (Вальтер де Грюйтер, 1996).
Google ученый
Шварц М. в « Истоки молекулярной биологии».Дань Жаку Моно (редакторы Lwoff, A. и Ullmann, A.) 207–216 (Academic Press, 1979).
Google ученый
Cases, I. & de Lorenzo, V. Принцип интеграции сигналов в бактериальных промоторах «черная кошка / белая кошка». EMBO J. 20 , 1–11 (2001).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Pul, Ü.И Вагнер, Р. в Бактериальный хроматин (ред. Дам, Р. Т. и Дорман, К. Дж.) 149–173 (Springer, 2010).
Google ученый
Дорман, К. Дж. H-NS: универсальный регулятор динамического генома. Nat. Rev. Microbiol. 2 , 391–400 (2004).
CAS PubMed Google ученый
Штобель, Д. М., Фри, А. и Дорман, К.J. Анти-молчание: преодоление опосредованной H-NS репрессии транскрипции у грамотрицательных кишечных бактерий. Микробиология 154 , 2533–2545 (2008).
CAS PubMed Google ученый
Ohniwa, R. L. et al. Динамическое состояние топологии ДНК важно для конденсации генома у бактерий. EMBO J. 25 , 5591–5602 (2006).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Мика, Б.И Marahiel, M.A. ДНК-связывающий белок HBsu необходим для нормального роста и развития у Bacillus subtilis . Biochimie 74 , 641–650 (1992).
CAS PubMed Google ученый
Grove, A. Функциональная эволюция бактериальных гистоноподобных белков HU. Curr. Вопросы Мол. Биол. 13 , 1–12 (2011).
CAS PubMed Google ученый
Болл, К.A., Osuna, R., Ferguson, K.C. & Johnson, R.C. Резкие изменения в уровнях Fis при повышении содержания питательных веществ в Escherichia coli . J. Bacteriol. 174 , 8043–8056 (1992).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Dame, R. T., Noom, M. C. & Wuite, G. J. Организация бактериального хроматина белком H-NS, раскрытая с использованием двойной манипуляции с ДНК. Природа 444 , 387–390 (2006).
CAS PubMed Google ученый
Dame, R. T., Wyman, C. & Goosen, N. Опосредованное H-NS уплотнение ДНК, визуализированное с помощью атомно-силовой микроскопии. Nucleic Acids Res. 28 , 3504–3510 (2000).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Maurer, S., Fritz, J. & Muskhelishvili, G. Систематическое исследование in vitro нуклеопротеиновых комплексов, образованных бактериальными нуклеоид-ассоциированными белками, выявляющее новые типы организации ДНК. J. Mol. Биол. 387 , 1261–1276 (2009).
CAS PubMed Google ученый
Грейнджер, Д. К., Херд, Д., Голдберг, М. Д. и Басби, С. Дж. Ассоциация нуклеоидных белков с кодирующими и некодирующими сегментами генома Escherichia coli . Nucleic Acids Res. 34 , 4642–4652 (2006).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Кахраманоглу, К.и другие. Прямые и косвенные эффекты H-NS и Fis на глобальный контроль экспрессии генов в Escherichia coli . Nucleic Acids Res. 39 , 2073–2091 (2011).
CAS PubMed Google ученый
Чо, Б. К., Найт, Э. М., Барретт, К. Л. и Палссон, Б. О. Полногеномный анализ связывания Fis в Escherichia coli указывает на причинную роль A- / AT-трактов. Genome Res. 18 , 900–910 (2008).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Singh, S. S. et al. Широко распространенное подавление инициации внутригенной транскрипции с помощью H-NS. Genes Dev. 28 , 214–219 (2014).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Vora, T., Hottes, A. K. & Tavazoie, S.Пейзаж белковой занятости бактериального генома. Мол. Ячейка 35 , 247–253 (2009). Новое приложение геномики для мониторинга белкового ландшафта в различных частях бактериальной хромосомы с прямым наблюдением участков генома, где транскрипция замалчивается.
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Haugen, S. P., Ross, W. & Gourse, R. L. Успехи в распознавании бактериального промотора и его контроле с помощью факторов, которые не связывают ДНК. Nat. Rev. Microbiol. 6 , 507–519 (2008).
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Локальная регуляция экспрессии генов промоторами днРНК, транскрипция и сплайсинг
Okazaki, Y. et al. Анализ транскриптома мыши на основе функциональной аннотации 60 770 полноразмерных кДНК. Природа 420 , 563–573 (2002)
ADS Google ученый
Капранов П.и другие. Карты РНК раскрывают новые классы РНК и возможную функцию всеобъемлющей транскрипции. Наука 316 , 1484–1488 (2007)
ADS CAS PubMed Google ученый
Guttman, M. et al. Сигнатура хроматина обнаруживает более тысячи высококонсервативных больших некодирующих РНК у млекопитающих. Природа 458 , 223–227 (2009)
ADS CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Карнинчи, П.и другие. Транскрипционный ландшафт генома млекопитающих. Наука 309 , 1559–1563 (2005)
ADS CAS Google ученый
Ли, Дж. Т. Уроки инактивации Х-хромосомы: длинные нкРНК как проводники и привязки к эпигеному. Genes Dev. 23 , 1831–1842 (2009)
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Нагано, Т.и другие. Некодирующая РНК Air эпигенетически подавляет транскрипцию, направляя G9a на хроматин. Наука 322 , 1717–1720 (2008)
ADS CAS PubMed Google ученый
Wang, K. C. et al. Длинная некодирующая РНК поддерживает активный хроматин для координации экспрессии гомеотических генов. Природа 472 , 120–124 (2011)
ADS CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Ørom, U.A. et al. Длинные некодирующие РНК с энхансероподобной функцией в клетках человека. Ячейка 143 , 46–58 (2010)
PubMed PubMed Central Google ученый
Guil, S. & Esteller, M. Cis -действующие некодирующие РНК: друзья и враги. Nat. Struct. Мол. Биол. 19 , 1068–1075 (2012)
CAS PubMed Google ученый
Эбисуя, М., Ямамото, Т., Накадзима, М. и Нишида, Э. Рябь из соседней транскрипции. Nat. Cell Biol. 10 , 1106–1113 (2008)
CAS PubMed Google ученый
Cabili, M. N. et al. Интегративная аннотация больших межгенных некодирующих РНК человека раскрывает глобальные свойства и специфические подклассы. Genes Dev. 25 , 1915–1927 (2011)
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Бассетт, А.R. et al. Соображения при исследовании функции днРНК in vivo . eLife 3 , e03058 (2014)
PubMed PubMed Central Google ученый
Li, G. et al. Обширные промотор-центрированные взаимодействия хроматина обеспечивают топологическую основу регуляции транскрипции. Ячейка 148 , 84–98 (2012)
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Раджагопал, Н.и другие. Высокопроизводительное картирование регуляторной ДНК. Nat. Biotechnol. 34 , 167–174 (2016)
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Yin, Y. et al. Противоположные роли преследующей днРНК и ее геномного локуса в регуляции активации гена HOXA во время дифференцировки эмбриональных стволовых клеток. Стволовая клетка 16 , 504–516 (2015)
CAS PubMed Google ученый
Паралкар, В.R. et al. Отсоединение днРНК от ассоциированного с ней цис- элемента. Мол. Ячейка 62 , 104–110 (2016)
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Martens, J. A., Laprade, L. & Winston, F. Межгенная транскрипция необходима для репрессии гена Saccharomyces cerevisiae SER3 . Природа 429 , 571–574 (2004)
ADS CAS PubMed Google ученый
Ширвин, К.Э., Каллен Б. П. и Иган Дж. Б. Вмешательство в транскрипцию — ускоренный курс. Trends Genet. 21 , 339–345 (2005)
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Purmann, A. et al. Геномная организация транскриптомов у млекопитающих: совместная регуляция и совместная функциональность. Genomics 89 , 580–587 (2007)
CAS PubMed Google ученый
Косак, С.T. et al. Координированная регуляция генов во время гемопоэза связана с геномной организацией. PLoS Biol. 5 , e309 (2007)
PubMed PubMed Central Google ученый
Бринстер, Р. Л., Аллен, Дж. М., Берингер, Р. Р., Гелинас, Р. Э. и Палмитер, Р. Д. Интроны повышают эффективность транскрипции у трансгенных мышей. Proc. Natl Acad. Sci. США 85 , 836–840 (1988)
ADS CAS PubMed Google ученый
Фонг, Ю.W. & Zhou, Q. Стимулирующий эффект факторов сплайсинга на удлинение транскрипции. Природа 414 , 929–933 (2001)
ADS CAS PubMed Google ученый
Calo, E. & Wysocka, J. Модификация хроматина энхансера: что, как и почему? Мол. Ячейка 49 , 825–837 (2013)
CAS PubMed Google ученый
Андерссон Р., Sandelin, A. & Danko, C.G. Унифицированная архитектура транскрипционных регуляторных элементов. Trends Genet. 31 , 426–433 (2015)
CAS PubMed Google ученый
Ким, Т.-К. И Шихаттар Р. Архитектурные и функциональные сходства энхансеров и промоторов. Ячейка 162 , 948–959 (2015)
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Нексуля, А.и другие. Эволюция репертуаров днРНК и паттернов экспрессии у четвероногих. Природа 505 , 635–640 (2014)
ADS CAS Google ученый
Hezroni, H. et al. Принципы эволюции длинной некодирующей РНК получены из прямого сравнения транскриптомов у 17 видов. Отчеты по ячейкам 11 , 1110–1122 (2015)
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Чен, Дж.и другие. Эволюционный анализ млекопитающих выявляет отдельные классы длинных некодирующих РНК. Genome Biol. 17 , 19 (2016)
КАС PubMed PubMed Central Google ученый
Bhatt, D. M. et al. Динамика транскриптов провоспалительных генов, выявленная с помощью анализа последовательностей фракций субклеточной РНК. Ячейка 150 , 279–290 (2012)
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Энгрейц, Дж.M. et al. РНК-РНК взаимодействия делают возможным специфическое нацеливание некодирующих РНК на возникающие пре-мРНК и сайты хроматина. Ячейка 159 , 188–199 (2014)
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Hsu, P. D. et al. Специфичность нацеливания на ДНК РНК-управляемых нуклеаз Cas9. Nat. Biotechnol. 31 , 827–832 (2013)
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Ван Т., Wei, J. J., Sabatini, D. M. & Lander, E. S. Генетический скрининг в клетках человека с использованием системы CRISPR-Cas9. Наука 343 , 80–84 (2014)
ADS CAS Google ученый
Keane, T. M. et al. Геномная изменчивость мышей и ее влияние на фенотипы и регуляцию генов. Природа 477 , 289–294 (2011)
ADS CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Конг, Л.и другие. Мультиплексная геномная инженерия с использованием систем CRISPR / Cas. Наука 339 , 819–823 (2013)
ADS CAS Статья Google ученый
Chen, B. et al. Динамическое отображение геномных локусов в живых клетках человека с помощью оптимизированной системы CRISPR / Cas. Ячейка 155 , 1479–1491 (2013)
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Шишкин, А.A. et al. Одновременное создание множества библиотек RNA-seq за одну реакцию. Nat. Методы 12 , 323–325 (2015)
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Engreitz, J., Lander, E. S. & Guttman, M. Антисмысловая очистка РНК (RAP) для картирования взаимодействий РНК с хроматином. Methods Mol. Биол. 1262 , 183–197 (2015)
CAS PubMed Google ученый
Энгрейц, Дж.M. et al. ДнРНК Xist использует трехмерную архитектуру генома для распространения по X-хромосоме. Наука 341 , 1237973 (2013)
PubMed PubMed Central Google ученый
Gnirke, A. et al. Отбор гибридных растворов с использованием сверхдлинных олигонуклеотидов для массового параллельного целевого секвенирования. Nat. Biotechnol. 27 , 182–189 (2009)
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Хуанг, С., Holt, J., Kao, C.-Y., McMillan, L. & Wang, W. Новый конвейер множественного выравнивания для высокопроизводительных данных секвенирования. База данных (Оксфорд) 2014 , bau057 (2014)
Google ученый
Guttman, M. et al. Ab initio Реконструкция типоспецифичных транскриптомов у мышей выявляет консервативную мультиэкзонную структуру lincRNAs. Nat. Biotechnol. 28 , 503–510 (2010)
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Левитт, Н., Бриггс, Д., Гил, А. и Праудфут, Н. Дж. Определение эффективного синтетического поли (А) сайта. Genes Dev. 3 , 1019–1025 (1989)
CAS PubMed Google ученый
Квак, Х., Фуда, Н. Дж., Кор, Л. Дж. И Лис, Дж. Т. Точные карты РНК-полимеразы показывают, как промоторы управляют инициацией и паузой. Наука 339 , 950–953 (2013)
ADS CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Core, L.Дж., Уотерфолл, Дж. Дж. И Лис, Дж. Т. Секвенирование зарождающейся РНК выявляет широко распространенные паузы и дивергентную инициацию на промоторах человека. Наука 322 , 1845–1848 (2008)
ADS CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Махат, Д. Б. и др. Картирование активных РНК-полимераз с разрешением пар оснований по всему геному с использованием прецизионного анализа ядер (PRO-seq). Nat. Протоколы 11 , 1455–1476 (2016)
PubMed Google ученый
Адельман, К.И Лис, Дж. Т. Промотор-проксимальная пауза РНК-полимеразы II: новые роли у многоклеточных животных. Nat. Преподобный Жене. 13 , 720–731 (2012)
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Buenrostro, J. D., Giresi, P. G., Zaba, L. C., Chang, H. Y. и Greenleaf, W. J. Транспозиция нативного хроматина для быстрого и чувствительного эпигеномного профилирования открытого хроматина, ДНК-связывающих белков и положения нуклеосом. Nat. Методы 10 , 1213–1218 (2013)
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Langmead, B. & Salzberg, S. L. Быстрое выравнивание по пробелам и чтению с Bowtie 2. Nat. Методы 9 , 357–359 (2012)
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Басби М. и др. Систематическое сравнение моноклональных и поликлональных антител для картирования модификаций гистонов с помощью ChIP-seq.Препринт на http://dx.doi.org/10.1101/054387 (2016)
Mouse ENCODE Consortium et al. Энциклопедия элементов ДНК мыши (Mouse ENCODE). Genome Biol. 13 , 418 (2012)
Kagey, M.H. et al. Медиатор и когезин связывают экспрессию генов и архитектуру хроматина. Природа 467 , 430–435 (2010)
ADS CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Диксон, Дж.R. et al. Топологические домены в геномах млекопитающих, идентифицированные с помощью анализа взаимодействий хроматина. Природа 485 , 376–380 (2012)
ADS CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Fort, A. et al. Глубокое профилирование транскриптома стволовых клеток млекопитающих подтверждает регуляторную роль ретротранспозонов в поддержании плюрипотентности. Nat. Genet. 46 , 558–566 (2014)
CAS PubMed Google ученый
Кент, В.J. et al. Браузер генома человека в UCSC. Genome Res. 12 , 996–1006 (2002)
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Гарбер М. и др. Выявление новых ограниченных элементов путем использования предвзятых схем замещения. Биоинформатика 25 , i54 – i62 (2009)
ADS CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Линдблад-То, К.и другие. Карта с высоким разрешением эволюционных ограничений человека с использованием 29 млекопитающих. Nature 478 , 476–482 (2011)
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Gentleman, R.C. et al. Биокондуктор: разработка открытого программного обеспечения для вычислительной биологии и биоинформатики. Genome Biol. 5 , R80 (2004)
PubMed PubMed Central Google ученый
Лоуренс М.и другие. Программное обеспечение для вычисления и аннотирования диапазонов генома. PLOS Comput. Биол. 9 , e1003118 (2013)
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Лоуренс, М., Джентльмен, Р. и Кэри, В. rtracklayer: пакет R для взаимодействия с браузерами генома. Биоинформатика 25 , 1841–1842 (2009)
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Куинлан, А.Р. и Холл, И. М. BEDTools: гибкий набор утилит для сравнения геномных характеристик. Биоинформатика 26 , 841–842 (2010)
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Робинсон, Дж. Т. и др. Программа просмотра интегративной геномики. Nat. Biotechnol. 29 , 24–26 (2011)
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Данечек, П.и другие. Вариант формата вызова и VCFtools. Биоинформатика 27 , 2156–2158 (2011)
CAS PubMed PubMed Central Google ученый
Локальное движение хроматина и транскрипция
Эукариотический хроматин — это комплекс нуклеиновых кислот и белков, который играет центральную роль в интерпретации информации, закодированной в геноме. Хроматин довольно неравномерно свернут внутри ядра в жидком состоянии, которое демонстрирует динамическое локальное движение.Высокодинамичная природа хроматина получает все большее признание, особенно в процессах, основанных на шаблонах ДНК, включая транскрипцию, поскольку это динамическое свойство обеспечивает определенную степень доступности ДНК даже в уплотненном хроматине. Многие белки глобально ограничивают локальные движения хроматина, которые, по-видимому, в основном управляются температурными колебаниями в живых клетках. Напр., Потеря комплекса cohesin, который может захватывать волокна хроматина, приводит к увеличению движения хроматина. Другим сдерживающим фактором движения хроматина является аппарат транскрипции.Хотя ранее считалось, что транскрипция требует открытого и высокодинамичного хроматина, в настоящее время ряд исследований указывает на более тонкую роль транскрипции в ограничении движения хроматина: динамическая кластеризация активной РНК-полимеразы II и других факторов транскрипции может служить центром который временно связывает активные области ДНК, подлежащие транскрипции, тем самым ослабляя сетку хроматина и ограничивая движение хроматина. Напротив, вне гетерохроматина транскрипционно менее активные области могут быть менее ограниченными, более динамичными и доступными, что подразумевает состояние высокой компетентности для быстрого и эффективного рекрутирования белковых факторов.Этот новый взгляд на взаимодействие локального движения хроматина и транскрипции отражает традиционные модели фабрик транскрипции и, в последнее время, жидкие капли факторов транскрипции, обеспечивая новое понимание функции хроматина.
Ключевые слова: Cohesin; Капля жидкости; Нуклеосома; РНК-полимераза II; Визуализация одиночных нуклеосом.
Расшифровка коротких аудиофайлов | Документация по преобразованию речи в текст
На этой странице показано, как преобразовать короткий аудиофайл в текст. с использованием синхронного распознавания речи.
Распознавание синхронной речи возвращает распознанный текст для короткого аудио (менее 60 секунд). Чтобы дольше обрабатывать запрос на распознавание речи для аудио чем 60 секунд, используйте Асинхронное распознавание речи.
Аудиоконтент можно отправлять напрямую в преобразование речи в текст из локального файла или Функция преобразования речи в текст может обрабатывать аудиоконтент, хранящийся в Сегмент Google Cloud Storage. См. Страницу квот и ограничений, чтобы узнать об ограничениях на синхронную речь. запросы на признание.
Примечание: Существует ограничение в 60 секунд и / или 10 МБ для всех запросов, отправляемых на API с использованием локальных аудиофайлов.Запросы, превышающие эту продолжительность и / или размер, будут приведет к ошибке. Для получения дополнительной информации см. документация по квотам и лимитам.Выполнение синхронного распознавания речи в локальном файле
Вот пример выполнения синхронного распознавания речи на локальном аудио файл:
ЛИНИЯ ОТДЫХА И CMD
Обратитесь к речи : распознать конечную точку API для полной
Детали. См. Справочную документацию RecognitionConfig.
для получения дополнительной информации о настройке тела запроса.
Аудиоконтент, поставляемый в теле запроса, должен быть в кодировке base64.
Для получения дополнительной информации о том, как кодировать base64
audio, см. Кодирование аудиоконтента Base64. Для большего
Информацию о поле содержимого см. в разделе RecognitionAudio.
Прежде чем использовать какие-либо данные запроса, сделайте следующие замены:
- LANGUAGE_CODE : код BCP-47 язык, на котором говорят в вашем аудиоклипе.
- КОДИРОВАНИЕ : кодирование аудио, которое вы хотите расшифровать.
- SAMPLE_RATE_HERTZ : частота дискретизации в герцах звука, который вы хотите расшифровать.
- ENABLE_TIME_WORD_OFFSETS : включите это поле, если вы хотите, чтобы возвращались смещения времени начала и окончания слова (временные метки).
- INPUT_AUDIO : закодированная в base64 строка аудиоданных, которые вы хотите расшифровать.
Метод HTTP и URL:
ЗАПИСЬ https: // Speech.googleapis.com/v1/speech:recognize
Тело запроса JSON:
{
"config": {
"languageCode": " LANGUAGE_CODE ",
"кодировка": КОДИРОВКА
"sampleRateHertz": SAMPLE_RATE_HERTZ
"enableTimeWordOffsets": ENABLE_TIME_WORD_OFFSETS
},
"audio": {
"content": " INPUT_AUDIO "
}
}
Чтобы отправить запрос, разверните одну из следующих опций:
curl (Linux, macOS или Cloud Shell)
Примечание: Убедитесь, что вы установили GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS переменную среды в путь к файлу закрытого ключа вашей учетной записи службы. Сохраните тело запроса в файле с именем request.json ,
и выполните следующую команду:
curl -X POST \
-H "Авторизация: носитель" $ (gcloud auth application-default print-access-token) \
-H "Content-Type: application / json; charset = utf-8" \
-d @ request.json \
"https://speech.googleapis.com/v1/speech:recognize"
PowerShell (Windows)
Примечание: Убедитесь, что вы установили GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS переменную среды в путь к файлу закрытого ключа вашей учетной записи службы. Сохраните тело запроса в файле с именем request.json ,
и выполните следующую команду:
$ cred = gcloud auth application-default print-access-token
$ headers = @ {"Authorization" = "Bearer $ cred"}Invoke-WebRequest `
-Method POST`
-Headers $ headers `
-ContentType: "application / json; charset = utf-8" `
-InFile запрос.json `
-Uri" https://speech.googleapis.com/v1/speech:recognize "| Select-Object -Expand Content
Вы должны получить ответ JSON, подобный следующему:
{
"полученные результаты": [
{
"альтернативы": [
{
"расшифровка": "сколько лет Бруклинскому мосту",
«уверенность»: 0,98267895
}
]
}
]
}
gcloud
См. признать команда для получения полной информации.
Для распознавания речи в локальном файле используйте gcloud инструмент командной строки, передавая локальный путь к файлу для выполнения
распознавание речи вкл.
gcloud ml распознавание речи ПУТЬ К ЛОКАЛЬНОМУ ФАЙЛУ --language-code = 'en-US'
В случае успешного запроса сервер возвращает ответ в формате JSON:
{
"полученные результаты": [
{
"альтернативы": [
{
«уверенность»: 0,9840146,
"расшифровка": "сколько лет Бруклинскому мосту"
}
]
}
]
}
Перейти
Ява
Узел.js
Питон
Дополнительные языки
С # : Пожалуйста, следуйте Инструкции по настройке C # на странице клиентских библиотек а затем посетите Справочная документация по преобразованию речи в текст для .NET.
PHP : Пожалуйста, следуйте Инструкции по настройке PHP на странице клиентских библиотек а затем посетите Справочная документация по преобразованию речи в текст для PHP.
Рубин : Пожалуйста, следуйте Инструкции по установке Ruby на странице клиентских библиотек а затем посетите Справочная документация по преобразованию речи в текст для Ruby.
Выполнение синхронного распознавания речи на удаленном файле
Для вашего удобства API преобразования речи в текст может выполнять синхронную распознавание речи непосредственно в аудиофайле, находящемся в Google Cloud Storage, без необходимости отправлять содержимое аудиофайла в теле вашего запрос.
Вот пример выполнения синхронного распознавания речи в файле находится в облачном хранилище:
ЛИНИЯ ОТДЫХА И CMD
Обратитесь к речи : распознать конечную точку API для полной
Детали. См. Справочную документацию RecognitionConfig.
для получения дополнительной информации о настройке тела запроса.
Аудиоконтент, поставляемый в теле запроса, должен быть в кодировке base64.
Для получения дополнительной информации о том, как кодировать base64
audio, см. Кодирование аудиоконтента Base64.Для большего
Информацию о поле содержимого см. в разделе RecognitionAudio.
Прежде чем использовать какие-либо данные запроса, сделайте следующие замены:
- LANGUAGE_CODE : код BCP-47 язык, на котором говорят в вашем аудиоклипе.
- КОДИРОВАНИЕ : кодирование аудио, которое вы хотите расшифровать.
- SAMPLE_RATE_HERTZ : частота дискретизации в герцах звука, который нужно расшифровать.
- ENABLE_TIME_WORD_OFFSETS : включите это поле, если вы хотите, чтобы возвращались смещения времени начала и окончания слова (временные метки).
- STORAGE_BUCKET : сегмент облачного хранилища.
- INPUT_AUDIO : файл аудиоданных, который вы хотите расшифровать.
Метод HTTP и URL:
POST https://speech.googleapis.com/v1/speech:recognize
Тело запроса JSON:
{
"config": {
"languageCode": " LANGUAGE_CODE ",
"кодировка": КОДИРОВКА
"sampleRateHertz": SAMPLE_RATE_HERTZ
"enableTimeWordOffsets": ENABLE_TIME_WORD_OFFSETS
},
"audio": {
"uri": "gs: // STORAGE_BUCKET / INPUT_AUDIO "
}
}
Чтобы отправить запрос, разверните одну из следующих опций:
curl (Linux, macOS или Cloud Shell)
Примечание: Убедитесь, что вы установили GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS переменную среды в путь к файлу закрытого ключа вашей учетной записи службы. Сохраните тело запроса в файле с именем request.json ,
и выполните следующую команду:
curl -X POST \
-H "Авторизация: носитель" $ (gcloud auth application-default print-access-token) \
-H "Content-Type: application / json; charset = utf-8" \
-d @ request.json \
"https://speech.googleapis.com/v1/speech:recognize"
PowerShell (Windows)
Примечание: Убедитесь, что вы установили GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS переменную среды в путь к файлу закрытого ключа вашей учетной записи службы. Сохраните тело запроса в файле с именем request.json ,
и выполните следующую команду:
$ cred = gcloud auth application-default print-access-token
$ headers = @ {"Authorization" = "Bearer $ cred"}Invoke-WebRequest `
-Method POST`
-Headers $ headers `
-ContentType: "application / json; charset = utf-8" `
-InFile запрос.json `
-Uri" https://speech.googleapis.com/v1/speech:recognize "| Select-Object -Expand Content
Вы должны получить ответ JSON, подобный следующему:
{
"полученные результаты": [
{
"альтернативы": [
{
"расшифровка": "сколько лет Бруклинскому мосту",
«уверенность»: 0,98267895
}
]
}
]
}
gcloud
См. признать команда для получения полной информации.
Для распознавания речи в локальном файле используйте gcloud инструмент командной строки, передавая локальный путь к файлу для выполнения
распознавание речи вкл.
gcloud ml распознает речь 'gs: //cloud-samples-tests/speech/brooklyn.flac' \ --language-code = 'en-US'
В случае успешного запроса сервер возвращает ответ в формате JSON:
{
"полученные результаты": [
{
"альтернативы": [
{
«уверенность»: 0,9840146,
"расшифровка": "сколько лет Бруклинскому мосту"
}
]
}
]
}
Перейти
Ява
Узел.js
Питон
Дополнительные языки
С # : Пожалуйста, следуйте Инструкции по настройке C # на странице клиентских библиотек а затем посетите Справочная документация по преобразованию речи в текст для .NET.
PHP : Пожалуйста, следуйте Инструкции по настройке PHP на странице клиентских библиотек а затем посетите Справочная документация по преобразованию речи в текст для PHP.
Рубин : Пожалуйста, следуйте Инструкции по установке Ruby на странице клиентских библиотек а затем посетите Справочная документация по преобразованию речи в текст для Ruby.
Частный, безопасный, авто-транскрипция. Локально, а НЕ в облаке.
Для производственных компаний, дистрибьюторов, студий, средств массовой информации и других лиц в сфере кино и развлечений.
[встроить] https://vimeo.com/313036199 [/ embed]
Я не хочу отправлять свои данные в облако
И вам не нужно.
Локальные функции транскрипции ИИ Саймона Сэйса:
- Точный ИИ, который работает локально, никакие данные не передаются в облако
- Расшифровка аудио / видео локально и офлайн
- Изящный пользовательский интерфейс, упрощающий импорт медиафайлов файлы ( просто перетащите) , редактируйте / аннотируйте / закладывайте расшифровки стенограмм и экспортируйте свои расшифровки в различных форматах
- Работает на Mac и ПК
- Обрабатывает практически все типы медиафайлов и кодеки
- Экспорт в текст, аудио / приложения для редактирования видео, такие как Avid Media Composer, Adobe Premiere и FCPX
- Поддерживает транскрипцию на основе временного кода / с точностью до кадра для сред видеопроизводства
Саймон Сайс начинал как облачный веб-сайт и приложения для транскрипции, а затем превратился в ведущий с нашим набором продуктов и функций.Тем не менее, многие клиенты приходили к нам и говорили, что хотят использовать его, но не могут из-за общих рисков, связанных с облаком. У них есть конфиденциальные проекты и / или клиенты со строгими требованиями соответствия (например, HIPAA, TPN, MPAA, SOC 2, CDSA), и только локальный продукт для транскрипции будет достаточным.
Мы создали искусственный интеллект Simon Says для всех, кто работает с высокочувствительным контентом.
Готовы начать?
Заполните форму , и мы вскоре свяжемся с вами по электронной почте.
Кто использует Саймон Говорит на месте:
- Компании, такие как маркетинг, коммуникации, PR, HR, продукты, юридические отделы
- Производственные компании, студии, вещатели
- Исследователи
- Новости / Медиа-организации
- Юридическая, медицинская и финансовая отрасли
- Университеты
Для чего они его используют:
- Создание доступного контента (например, субтитров / видео с субтитрами) для веб-сайтов, социальных сетей, внутреннего обучения;
- Расшифровка интервью, например, для исследований и развития клиентов
- Расшифровка встреч, выступлений, презентаций
- Расшифровка поспешных / ежедневных сообщений для постпроизводства
- Редактирование субтитров / подписей видео
Системные требования:
- Mac или Windows
- 4-ядерный ЦП минимум
- 16 ГБ ОЗУ, предпочтительно 32 ГБ +
- 20 ГБ на жестком диске
- Большинство современных компьютеров легко удовлетворяют вышеуказанным требованиям.
- Минимальное обязательство:
- 100 часов транскрипции.
Заинтересованы в получении Саймона Сэйса на месте? Узнайте больше здесь.
3 бесплатных инструмента для транскрипции, которые вы можете попробовать
Транскрипция отличная умение практиковаться в нашем онлайн-мире. Вы можете использовать его для письменных записей практически всего, чтобы улучшить доступность вашего онлайн-контента или максимизировать свой SEO.
Существует множество бесплатных вариантов, которые могут принести результаты, если у вас есть время сделать это самостоятельно.
Вот пять бесплатных инструментов для расшифровки, которые мы опробовали.
1. ОтписатьOTranscribe — это бесплатный инструмент с открытым исходным кодом, который можно использовать прямо из вашего веб-браузера. У него простой интерфейс, который позволяет вам управлять аудиоплеером и текстовым редактором в одном окне, а это значит, что вам не нужно выходить за пределы вкладок, чтобы останавливать и запускать звук. Всем можно управлять с помощью клавиатуры, а интерактивные отметки времени помогают ориентироваться в стенограмме.OTranscribe также автоматически сохраняет ваш прогресс по мере вашего продвижения.
Для начала просто загрузите аудио- или видеофайл или введите ссылку на видео YouTube. Затем игрок сядьте слева от текстового поля, чтобы вы могли выполнять всю свою работу в одном окне.
OTranscribe также позволяет настраивать сочетания клавиш, чтобы вы могли адаптировать их к своему стилю расшифровки.
Одно замечание: OTranscribe сохраняет работу только в виде файла RTF, поэтому скопируйте текст, как только он будет готов, если вы хотите сохранить его в другом формате.
2. Экспресс-справочникExpress Scribe — популярный в отрасли инструмент, предназначенный для профессиональных переводчиков. Его можно бесплатно установить на Mac или ПК, и вы сможете управлять всем с помощью клавиатуры или с помощью ножной педали. Он имеет простой в освоении интерфейс и широкий спектр элементов управления с помощью горячих клавиш для повышения скорости и эффективности.
Существует как бесплатная, так и платная версия Express. Писец. Бесплатная версия включает опору для ножной педали и может воспроизводить широкий диапазон типов аудиофайлов.
Express Scribe также позволяет настраивать параметры воспроизведения файла в соответствии со скоростью набора текста.
3. Расшифровщик FTWЕще один популярный вариант для профессиональных транскриберов, FTW Transcriber — это загружаемый инструмент с высококачественным воспроизведением звука. Он поддерживает ряд типов аудио- и видеофайлов и имеет автоматические отметки времени.
Этот инструмент отображается на экране в виде небольшой оранжевой рамки, которую вы можете переместить в нужное место.В этом поле вы можете воспроизводить, приостанавливать, регулировать громкость и пропускать звук вперед и назад.
FTW Transcriber может использоваться на смартфонах и планшетах для дополнительного удобства. Однако следует отметить следующее: он совместим только с операционными системами Windows и Android.
4. ПодписатьсяInqscribe — это загружаемый инструмент с простым интерфейсом, который позволяет пользователям выполнять всю транскрипцию в одном окне. Он имеет широкий спектр сочетаний клавиш, которые можно настроить в соответствии с вашим стилем и потребностями.Inqscribe позволяет создавать фрагменты, поэтому вы можете вставлять любые часто используемые выражения в текст простым нажатием клавиши. Вы можете вставить временные коды в любое место в стенограмме и позже создать на их основе файл с субтитрами.
Медиаплеер Inqscribe может воспроизводить аудио и видео с URL-адреса, сервера, файлов с вашего жесткого диска, флэш-накопителя или компакт-диска.
5. РасшифроватьTranscribe — это оптимизированный инструмент, который предоставляет два варианта транскрипции, в зависимости от вашего предпочтительный стиль.Расшифруйте файл традиционным способом, набрав его или воспользуйтесь функцией диктовки Transcribe, которая преобразует ваш голос в текст с помощью распознавания голоса.
Вариант набораЕсли вы используете традиционный вариант транскрипции, Transcribe имеет тесно интегрированный проигрыватель и редактор, которые можно использовать для управления скоростью звука при вводе текста. Он также имеет автоматический расширитель текста, который позволяет вам использовать фрагменты вместо того, чтобы печатать длинные отрывки текста несколько раз.
Возможность диктовкиПараметр «Диктовка» прост в использовании и, как правило, быстрее, чем ввод текста. Чтобы использовать эту опцию, вам понадобится микрофон. Если вы используете только свой голос, просто начните говорить в приложение и увидите, как ваши слова появляются на экране. Чтобы расшифровать файл со звуком, вам нужно будет прослушать звук и повторить то, что вы слышите, в микрофон. Это похоже на то, как респонденты Ai-Media работают над созданием субтитров в реальном времени. Это может потребовать некоторой практики!
На заметку: Transcribe предлагает бесплатное использование своего программного обеспечения только в течение одной недели.
Тебе уже не остановить!Станьте на шаг ближе к тому, чтобы стать лучшим транскрибером, попробовав один из предложенных нами инструментов.
И если тяжелая расшифровка не для вас, вы можете сделать расшифровку ваших аудио- и видеофайлов специалистом за небольшую плату. Ai-Media предлагает быстрые и надежные услуги транскрипции через Scribblr-Ai. Этот инструмент может похвастаться точностью 99%, доступен круглосуточно и совместим с различными акцентами и диалектами.Свяжитесь с нами, чтобы узнать больше! Или найдите другие инструменты на сайте Ai-Media.
.